Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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