Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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