Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5U1

Ighv1-16, Immunoglobulin heavy variable 1-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-16A0A075B5U1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-16A0A075B5U1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-16A0A075B5U1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-16A0A075B5U1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ighv1-16A0A075B5U1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms