Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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