Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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COPS7AQ9UBW8 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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COPS7AQ9UBW8 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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COPS7AQ9UBW8 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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COPS7AQ9UBW8 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
COPS7AQ9UBW8 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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