Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.54□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
C10orf55Q5SWW7 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms