Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm3550W4VSN7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms