Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VarsQ9Z1Q9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms