Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp2Q9Z0E6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbp2Q9Z0E6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms