Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srd5a3Q9WUP4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms