Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd3Q9WU40 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lemd3Q9WU40 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms