Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms