Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms