Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms