Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms