Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms