Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn8Q9QZ49 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms