Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lsm4Q9QXA5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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