Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms