Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sfmbt1Q9JMD1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms