Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms