Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms