Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrfQ9JM73 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms