Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cabp1Q9JLK7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp1Q9JLK7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms