Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms