Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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