Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Bco1Q9JJS6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Bco1Q9JJS6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Bco1Q9JJS6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Bco1Q9JJS6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Bco1Q9JJS6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bco1Q9JJS6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Bco1Q9JJS6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Bco1Q9JJS6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Bco1Q9JJS6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Bco1Q9JJS6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms