Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc86Q9JJ89 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc86Q9JJ89 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms