Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Praf2Q9JIG8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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