Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms