Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sphk2Q9JIA7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sphk2Q9JIA7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sphk2Q9JIA7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sphk2Q9JIA7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sphk2Q9JIA7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sphk2Q9JIA7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sphk2Q9JIA7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sphk2Q9JIA7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sphk2Q9JIA7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms