Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LratQ9JI60 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms