Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtf2ird1Q9JI57 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms