Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms