Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RhojQ9ER71 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhojQ9ER71 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms