Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn4aQ9ER60 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms