Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms