Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms