Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a3Q9DCP2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms