Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Xab2Q9DCD2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms