Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf4Q9DAW6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf4Q9DAW6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms