Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnpy3Q9DAU1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Cnpy3Q9DAU1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnpy3Q9DAU1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnpy3Q9DAU1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnpy3Q9DAU1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnpy3Q9DAU1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnpy3Q9DAU1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnpy3Q9DAU1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnpy3Q9DAU1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnpy3Q9DAU1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms