Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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