Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp12Q9D9M2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp12Q9D9M2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp12Q9D9M2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Usp12Q9D9M2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Usp12Q9D9M2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Usp12Q9D9M2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Usp12Q9D9M2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp12Q9D9M2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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