Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D9H8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D9H8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms