Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot8Q9D8X5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot8Q9D8X5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms