Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn22Q9D7U6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms