Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms