Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsf13Q9D777 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf13Q9D777 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms