Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Zcchc13Q9D548 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zcchc13Q9D548 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zcchc13Q9D548 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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